Detalhe da pesquisa
1.
The source of the Black Death in fourteenth-century central Eurasia.
Nature
; 606(7915): 718-724, 2022 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35705810
2.
Stone Age Yersinia pestis genomes shed light on the early evolution, diversity, and ecology of plague.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 119(17): e2116722119, 2022 04 26.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35412864
3.
Paleomicrobiology: Diagnosis and Evolution of Ancient Pathogens.
Annu Rev Microbiol
; 73: 639-666, 2019 09 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31283430
4.
Genome Structure, Life Cycle, and Taxonomy of Coronaviruses and the Evolution of SARS-CoV-2.
Curr Top Microbiol Immunol
; 439: 305-339, 2023.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36592250
5.
Computational strategies to combat COVID-19: useful tools to accelerate SARS-CoV-2 and coronavirus research.
Brief Bioinform
; 22(2): 642-663, 2021 03 22.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33147627
6.
Reconstruction of the Genetic History and the Current Spread of HIV-1 Subtype A in Germany.
J Virol
; 93(12)2019 06 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30944175
7.
Phenotypic deficits in the HIV-1 envelope are associated with the maturation of a V2-directed broadly neutralizing antibody lineage.
PLoS Pathog
; 14(1): e1006825, 2018 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29370298
8.
Quantifying the fitness cost of HIV-1 drug resistance mutations through phylodynamics.
PLoS Pathog
; 14(2): e1006895, 2018 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29462208
9.
BEAST 2.5: An advanced software platform for Bayesian evolutionary analysis.
PLoS Comput Biol
; 15(4): e1006650, 2019 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30958812
10.
Tracing the Impact of Public Health Interventions on HIV-1 Transmission in Portugal Using Molecular Epidemiology.
J Infect Dis
; 220(2): 233-243, 2019 06 19.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30805610
11.
Taming the BEAST-A Community Teaching Material Resource for BEAST 2.
Syst Biol
; 67(1): 170-174, 2018 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28673048
12.
Phylogenetic Tools for Generalized HIV-1 Epidemics: Findings from the PANGEA-HIV Methods Comparison.
Mol Biol Evol
; 34(1): 185-203, 2017 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28053012
13.
Phylodynamics with Migration: A Computational Framework to Quantify Population Structure from Genomic Data.
Mol Biol Evol
; 33(8): 2102-16, 2016 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-27189573
14.
Phylodynamics of Enterovirus A71-Associated Hand, Foot, and Mouth Disease in Viet Nam.
J Virol
; 89(17): 8871-9, 2015 Sep.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26085170
15.
Birth-death skyline plot reveals temporal changes of epidemic spread in HIV and hepatitis C virus (HCV).
Proc Natl Acad Sci U S A
; 110(1): 228-33, 2013 Jan 02.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-23248286
16.
How well can the exponential-growth coalescent approximate constant-rate birth-death population dynamics?
Proc Biol Sci
; 282(1806): 20150420, 2015 May 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-25876846
17.
Efficient Bayesian inference under the structured coalescent.
Bioinformatics
; 30(16): 2272-9, 2014 Aug 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24753484
18.
Influenza a virus migration and persistence in North American wild birds.
PLoS Pathog
; 9(8): e1003570, 2013.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24009503
19.
BEAST 2: a software platform for Bayesian evolutionary analysis.
PLoS Comput Biol
; 10(4): e1003537, 2014 Apr.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-24722319
20.
Recombination-aware phylogenetic analysis sheds light on the evolutionary origin of SARS-CoV-2.
Sci Rep
; 14(1): 541, 2024 01 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38177346